Grupa prof. Zofii Szweykowskiej-Kulińskiej
praca licencjacka:
- Analiza profilu eskresji genów kodujących czynniki transkrypcyjne SPL u rozdzielnopłciowego watrobowca polymorpha.
- Rola białka Hyl1w regulacji transkrypcji genów mikroRNA i białek thaliana
praca magisterska:
- Analiza ekspresji krótkich peptydów kodowanych w rejonach 5’UTR genów kodujących czynniki transkrypcyjne SPL u wątrobowca M.
- Identyfikacja i analiza potencjalnych miejsc metylacji kierowanych przez mikroRNA w jęczmieniu.
- Nowe elementy genetyczne odpowiedzi ziemniaka na stres suszy.
- Rola jęczmiennych mikroRNA z rodziny MIR444 w rozwoju rośliny i odpowiedzi na stresy abiotyczne
Grupa prof. Artura Jarmołowskiego
Prace magisterskie:
- Rola Ago1 w regulacji alternatywnego splicingu i kontranskrypcyjnej biogenezy mikroRNA A.thaliana
- Dialog maszynerii splicingowej i poliadenylacyjnej w regulacji biogenezy mikroRNA A.thaliana.
- „Rola białka Argonaute 1 w regulacji splicingu alternatywnego u Arabidopsis thaliana”. (dr Jakub Dolata)
Prace licencjackie
- Kotranskrypcyjna regulacja ekspresji genów u roślin (teoretyczna; dr Jakub Dolata)
- Uzyskanie i charakterystyka linii transgenicznych Arabidopsis thalianaz ekspresją allelu dcl1-13 (dr Dawid Bielewicz)
- Analiza oddziaływań między białkiem HYL1 a białkami CDC5 i DRB4 (dr Dawid Bielewicz)
dr Jakub Dolata
- Molekularna charakterystyka syntaz pseurourydynowych u Arabidopsis thaliana
Grupa dr hab. Katarzyny Doroty Raczyńskiej
- Oddziaływanie dimeru białek Lsm10:Lsm11 z innymi białkami i RNA w różnych fazach cyklu komórek ludzkich.The interaction of Lsm10:Lsm11 protein dimer with other proteins and RNAs in different phases of the cell cycle in human cells
- Oddziaływanie białek Lsm10 i/lub Lsm11 z małymi, niekodującymi RNA w komórkach ludzkich.The interaction of Lsm10 and/or Lsm11 with small noncoding RNAs in human cells.
Laboratorium Bioinformatyki strukturalnej (grupa prof. Janusza Bujnickiego)
Licencjaty:
- Rozbudowa narzędzi bioinformatycznych do wizualizacji modelowania struktur kompleksów makromolekularnych
Development of bioinformatics tools for visualization of structural models for macromolecular complexes
Prace magisterskie:
- Rozwój i zastosowanie metod komputerowego modelowania struktur kompleksów białek i kwasów nukleinowych
Development and application of method for computational modeling of protein and nucleic acid complexes
Laboratorium Systemów Ewolucyjnych (grupa prof. Borysa Wrobla)
Temat prac licencjackich
- Rozbudowa oprogramowania do ewolucji sztucznych sieci genowych kontrolujacych animaty
- Stworzenie oprogramowania pozwalającego na analizę czynności elektrycznej mięśni
- Stworzenie oprogramowania pozwalającego na analizę sieci społecznościowych
Temat pracy magisterskiej:
- Wykorzystanie sztucznych sieci genowych w robotyce ewolucyjnej
- Wykorzystanie analizy czynności elektrycznej mięśni w rehabilitacji
- Zastosowanie analizy sieci złożonych w badaniach społecznych
Laboratorium Biomolekularnych Interakcji I Transportu (dr Jan Brezovsky, prof. UAM)
- Study of molecular mechanisms of mutations in biologically relevant enzymes underlying disease development
- Identification of bioactive small molecules of biomedically important proteins
- Computational protein engineering towards improved enzymes for biotechnologies
Laboratorium Komórek Macierzystych (grupa prof. Małgorzaty Borowiak)
Prace magisterskie/licencjackie
- Mechanizm ekspansji komórek progenitorowych in vitro.
- Rola lncRNA w pluripotencji
- Indukowany światłem system ekspresji genów w procesie różnicowania in vitro
Laboratorium Terapii Genowej (grupa prof. Krzysztofa Sobczaka)
Prace magisterskie/licencjackie
- Zastosowanie antysensowych oligonukleotydów w celu obniżenia biosyntezy toksycznego białka poliglicynowego w modelach komórkowych z ekspansją powtórzeń trójnukleotydowych CGG
- Określenie znaczenia alternatywnej poliadenylacji prekursora onkogenu miR-21 na poziom jego dojrzałego produktu
Grupa dr Magdaleny Masłoń
Temat pracy magisterskiej:
- Analiza kinetyki transkrypcji podczas różnicowanie komórek
- Stworzenie metodą Crispr/Cas9 komórkowego modelu Polimerazy RNA II o zwiększonej prędkości i analiza konsekwencji wprowadzonej mutacji
- Zmiany w interaktomie Polimerazy RNA II podczas różnicowanie komórek